- Bestimmen Sie das Schicksal Ihres Mutanten:
Während des gesamten Spiels steuert der Spieler das Schicksal und die Entwicklung von einem der drei brandneuen Mutanten, indem er über seine Fähigkeiten und seine Zugehörigkeit der Mutanten entscheidet. Dies bestimmt welche Mutanten gemeinsam mit dem Spieler oder gegen den Spieler kämpfen, welchen Gegnern er gegenüberstehen wird und ob er sich den XMen oder der Bruderschaft der Mutantenanschließt

- Entfesseln Sie Ihre Mutantenkräfte:
Der Spieler wählt einen von drei völlig neuen Charakteren und übernimmt die Kontrolle des Charakters zum entscheidendsten Zeitpunkt – wenn er seine Mutantenkräfte entdeckt. Er wählt danach eine der drei verschiedenen Hauptkräfte, welche die genetische Grundlage ihrer Mutantenkräfte legen. Der Spieler hat das erste Mal in einem X-Men Spiel die Möglichkeit die verschiedenen Kräfte für seinen Charakter auszuwählen und diese zu kombinieren und anzupassen.

- Folgen Sie den genetischen Fußstapfen eines anderen Mutanten:
X-Gene – direkte Implementierungen von anderen X-Men Fähigkeiten – liefern dem Spieler einen höheren Grad der Individualisierung seiner Superkräfte und bieten ihm die Möglichkeit die Mutantenkräfte anderer X-Men zu erleben, wie zum Beispiel die Frostkräfte von Iceman oder die Feuerkräfte von Pyro, und diese dann in einzigartigen Kämpfen auf verschiedene Art und Weise einzusetzen.

- Ihre Entscheidungen bestimmen die Geschichte:
Der Spieler hat die Möglichkeit moralische Entscheidungen über die Schicksale seiner neuen Mutanten im Spiel zu treffen ohne sicher zu wissen ob diese die richtigen waren.